Pochowany na terenie lapidarium przy kościele św. Krzyża, tuż obok placu swojego imienia, gdzie niegdyś mieszkał w jednej z kamienic. Z okazji 220. rocznicy urodzin Jana Metziga, oddając hołd wybitnemu lekarzowi i posłowi, Rada Miejska Leszna ustanowiła rok 2024 w Lesznie Rokiem doktora Jana Metziga.
